Sebagai upaya dalam mencapai visi tersebut, Program Studi Logistik Kelautan memiliki misi:

• Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran secara proporsional bidang keahlian logistik kelautan berstandar nasional.
• Menyelenggarakan penelitian untuk menciptakan dan mengembangkan teori dan praktik di bidang logistik kelautan yang inovatif dalam upaya mengembangkan jaringan logistik nasional sesuai dengan karakteristik negara kepulauan dan negara maritim.
• Menerapkan teknologi informasi dalam bidang logistik kelautan sesuai era industri 4.0 dalam pendidikan, penelitian, dan pengabdian serta pemberdayaan kepada masyarakat berbasis hasil penelitian.
• Mengembangkan dan menyebarluaskan keilmuan dan teknologi serta temuan-temuan inovatif bidang logistik kelautan yang berbasis pada kebutuhan masyarakat dan industri.